Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXD8P13378 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXD8P13378 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXD8P13378 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms