Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DEFA4P12838 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEFA4P12838 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEFA4P12838 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEFA4P12838 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEFA4P12838 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEFA4P12838 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEFA4P12838 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DEFA4P12838 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DEFA4P12838 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEFA4P12838 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEFA4P12838 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DEFA4P12838 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEFA4P12838 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEFA4P12838 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEFA4P12838 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA4P12838 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA4P12838 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA4P12838 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA4P12838 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA4P12838 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA4P12838 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA4P12838 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA4P12838 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA4P12838 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA4P12838 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA4P12838 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms