Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT3P12035 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT3P12035 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT3P12035 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT3P12035 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT3P12035 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT3P12035 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT3P12035 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT3P12035 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT3P12035 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT3P12035 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT3P12035 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT3P12035 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT3P12035 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT3P12035 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT3P12035 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT3P12035 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT3P12035 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT3P12035 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT3P12035 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT3P12035 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT3P12035 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT3P12035 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT3P12035 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT3P12035 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT3P12035 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT3P12035 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT3P12035 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT3P12035 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT3P12035 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT3P12035 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT3P12035 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT3P12035 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT3P12035 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT3P12035 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT3P12035 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT3P12035 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT3P12035 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT3P12035 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT3P12035 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT3P12035 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT3P12035 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT3P12035 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT3P12035 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT3P12035 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT3P12035 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT3P12035 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT3P12035 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT3P12035 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT3P12035 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT3P12035 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT3P12035 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT3P12035 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT3P12035 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT3P12035 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT3P12035 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT3P12035 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT3P12035 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT3P12035 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT3P12035 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT3P12035 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT3P12035 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT3P12035 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT3P12035 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT3P12035 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT3P12035 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT3P12035 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT3P12035 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT3P12035 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT3P12035 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT3P12035 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT3P12035 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT3P12035 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT3P12035 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT3P12035 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT3P12035 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT3P12035 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT3P12035 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT3P12035 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT3P12035 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT3P12035 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT3P12035 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT3P12035 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT3P12035 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT3P12035 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT3P12035 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT3P12035 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT3P12035 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT3P12035 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT3P12035 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT3P12035 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT3P12035 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT3P12035 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT3P12035 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT3P12035 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT3P12035 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT3P12035 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT3P12035 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT3P12035 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT3P12035 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms