Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBP3P10745 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBP3P10745 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBP3P10745 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBP3P10745 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBP3P10745 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RBP3P10745 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBP3P10745 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBP3P10745 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBP3P10745 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RBP3P10745 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBP3P10745 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBP3P10745 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBP3P10745 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBP3P10745 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBP3P10745 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBP3P10745 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBP3P10745 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBP3P10745 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBP3P10745 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBP3P10745 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBP3P10745 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RBP3P10745 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBP3P10745 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBP3P10745 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBP3P10745 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBP3P10745 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBP3P10745 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBP3P10745 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBP3P10745 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBP3P10745 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBP3P10745 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBP3P10745 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RBP3P10745 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBP3P10745 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBP3P10745 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBP3P10745 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBP3P10745 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBP3P10745 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBP3P10745 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBP3P10745 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBP3P10745 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBP3P10745 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBP3P10745 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBP3P10745 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBP3P10745 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBP3P10745 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBP3P10745 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBP3P10745 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBP3P10745 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBP3P10745 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBP3P10745 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBP3P10745 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBP3P10745 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBP3P10745 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBP3P10745 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBP3P10745 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBP3P10745 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBP3P10745 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBP3P10745 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBP3P10745 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBP3P10745 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBP3P10745 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBP3P10745 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBP3P10745 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBP3P10745 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBP3P10745 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBP3P10745 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBP3P10745 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBP3P10745 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBP3P10745 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RBP3P10745 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RBP3P10745 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RBP3P10745 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBP3P10745 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBP3P10745 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RBP3P10745 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBP3P10745 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBP3P10745 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBP3P10745 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBP3P10745 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBP3P10745 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBP3P10745 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBP3P10745 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBP3P10745 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBP3P10745 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBP3P10745 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP3P10745 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP3P10745 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP3P10745 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP3P10745 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP3P10745 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP3P10745 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP3P10745 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP3P10745 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP3P10745 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP3P10745 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBP3P10745 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP3P10745 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBP3P10745 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms