Protein–RNA interactions for Protein: P10600

TGFB3, Transforming growth factor beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3P10600 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TGFB3P10600 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TGFB3P10600 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TGFB3P10600 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms