Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXB5P09067 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB5P09067 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms