Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SRPRAP08240 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SRPRAP08240 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRPRAP08240 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms