Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOP08100 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOP08100 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOP08100 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOP08100 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOP08100 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOP08100 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOP08100 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOP08100 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOP08100 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOP08100 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOP08100 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOP08100 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOP08100 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOP08100 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOP08100 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOP08100 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOP08100 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOP08100 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOP08100 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOP08100 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOP08100 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOP08100 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOP08100 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOP08100 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOP08100 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOP08100 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOP08100 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOP08100 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOP08100 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOP08100 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOP08100 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOP08100 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOP08100 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RHOP08100 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOP08100 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOP08100 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOP08100 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOP08100 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOP08100 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOP08100 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOP08100 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOP08100 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOP08100 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOP08100 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOP08100 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOP08100 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOP08100 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOP08100 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOP08100 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOP08100 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOP08100 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOP08100 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOP08100 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOP08100 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOP08100 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOP08100 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOP08100 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOP08100 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOP08100 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOP08100 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOP08100 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOP08100 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOP08100 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOP08100 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOP08100 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOP08100 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOP08100 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOP08100 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOP08100 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOP08100 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOP08100 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOP08100 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOP08100 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOP08100 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOP08100 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOP08100 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOP08100 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOP08100 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOP08100 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOP08100 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOP08100 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOP08100 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOP08100 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOP08100 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOP08100 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOP08100 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOP08100 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOP08100 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOP08100 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOP08100 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOP08100 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOP08100 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RHOP08100 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOP08100 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOP08100 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOP08100 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOP08100 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOP08100 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOP08100 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms