Protein–RNA interactions for Protein: P06730

EIF4E, Eukaryotic translation initiation factor 4E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EP06730 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EIF4EP06730 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EIF4EP06730 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EIF4EP06730 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EIF4EP06730 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EIF4EP06730 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EIF4EP06730 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EIF4EP06730 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EIF4EP06730 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EIF4EP06730 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EIF4EP06730 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EIF4EP06730 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EIF4EP06730 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms