Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRB1P04280 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRB1P04280 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRB1P04280 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRB1P04280 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRB1P04280 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRB1P04280 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRB1P04280 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRB1P04280 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRB1P04280 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRB1P04280 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRB1P04280 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRB1P04280 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRB1P04280 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PRB1P04280 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PRB1P04280 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRB1P04280 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRB1P04280 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRB1P04280 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRB1P04280 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRB1P04280 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRB1P04280 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRB1P04280 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRB1P04280 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRB1P04280 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRB1P04280 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRB1P04280 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRB1P04280 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRB1P04280 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRB1P04280 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PRB1P04280 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRB1P04280 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRB1P04280 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRB1P04280 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRB1P04280 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRB1P04280 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRB1P04280 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRB1P04280 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRB1P04280 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRB1P04280 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRB1P04280 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PRB1P04280 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PRB1P04280 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRB1P04280 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRB1P04280 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRB1P04280 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRB1P04280 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRB1P04280 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRB1P04280 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRB1P04280 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PRB1P04280 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRB1P04280 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRB1P04280 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRB1P04280 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PRB1P04280 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRB1P04280 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRB1P04280 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRB1P04280 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRB1P04280 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRB1P04280 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRB1P04280 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRB1P04280 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRB1P04280 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRB1P04280 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRB1P04280 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PRB1P04280 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PRB1P04280 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRB1P04280 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRB1P04280 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRB1P04280 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRB1P04280 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRB1P04280 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRB1P04280 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PRB1P04280 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRB1P04280 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRB1P04280 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PRB1P04280 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRB1P04280 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRB1P04280 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRB1P04280 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRB1P04280 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRB1P04280 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRB1P04280 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRB1P04280 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRB1P04280 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PRB1P04280 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRB1P04280 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRB1P04280 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRB1P04280 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRB1P04280 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PRB1P04280 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRB1P04280 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRB1P04280 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRB1P04280 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRB1P04280 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PRB1P04280 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRB1P04280 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRB1P04280 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRB1P04280 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRB1P04280 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms