Protein–RNA interactions for Protein: P04264

KRT1, Keratin, type II cytoskeletal 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT1P04264 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT1P04264 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT1P04264 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT1P04264 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT1P04264 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT1P04264 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT1P04264 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT1P04264 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT1P04264 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT1P04264 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT1P04264 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT1P04264 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT1P04264 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT1P04264 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT1P04264 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT1P04264 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT1P04264 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT1P04264 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT1P04264 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT1P04264 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT1P04264 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT1P04264 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT1P04264 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT1P04264 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT1P04264 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT1P04264 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT1P04264 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT1P04264 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT1P04264 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT1P04264 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT1P04264 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT1P04264 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT1P04264 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT1P04264 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT1P04264 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT1P04264 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT1P04264 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT1P04264 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT1P04264 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT1P04264 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT1P04264 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT1P04264 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT1P04264 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT1P04264 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT1P04264 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT1P04264 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT1P04264 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT1P04264 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT1P04264 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT1P04264 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT1P04264 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT1P04264 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT1P04264 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT1P04264 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT1P04264 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT1P04264 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT1P04264 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT1P04264 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT1P04264 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT1P04264 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT1P04264 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT1P04264 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT1P04264 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT1P04264 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT1P04264 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT1P04264 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT1P04264 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT1P04264 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT1P04264 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT1P04264 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT1P04264 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KRT1P04264 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT1P04264 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT1P04264 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KRT1P04264 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KRT1P04264 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT1P04264 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT1P04264 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT1P04264 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT1P04264 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT1P04264 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT1P04264 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT1P04264 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT1P04264 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT1P04264 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT1P04264 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT1P04264 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT1P04264 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT1P04264 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT1P04264 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT1P04264 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT1P04264 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT1P04264 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT1P04264 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT1P04264 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT1P04264 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT1P04264 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT1P04264 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT1P04264 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT1P04264 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms