Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOA1P02647 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOA1P02647 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOA1P02647 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOA1P02647 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA1P02647 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA1P02647 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA1P02647 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA1P02647 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA1P02647 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA1P02647 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA1P02647 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA1P02647 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA1P02647 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA1P02647 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA1P02647 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOA1P02647 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOA1P02647 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOA1P02647 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOA1P02647 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOA1P02647 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOA1P02647 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOA1P02647 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
APOA1P02647 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOA1P02647 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
APOA1P02647 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOA1P02647 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
APOA1P02647 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOA1P02647 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA1P02647 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA1P02647 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA1P02647 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA1P02647 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA1P02647 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA1P02647 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA1P02647 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA1P02647 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA1P02647 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOA1P02647 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA1P02647 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA1P02647 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA1P02647 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA1P02647 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA1P02647 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA1P02647 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA1P02647 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA1P02647 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA1P02647 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOA1P02647 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA1P02647 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA1P02647 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA1P02647 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA1P02647 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA1P02647 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA1P02647 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA1P02647 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA1P02647 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA1P02647 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA1P02647 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA1P02647 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOA1P02647 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA1P02647 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA1P02647 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA1P02647 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA1P02647 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA1P02647 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA1P02647 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA1P02647 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA1P02647 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA1P02647 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA1P02647 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOA1P02647 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOA1P02647 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOA1P02647 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOA1P02647 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOA1P02647 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOA1P02647 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOA1P02647 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOA1P02647 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOA1P02647 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOA1P02647 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOA1P02647 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOA1P02647 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOA1P02647 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
APOA1P02647 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOA1P02647 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOA1P02647 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOA1P02647 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOA1P02647 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOA1P02647 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOA1P02647 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOA1P02647 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOA1P02647 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOA1P02647 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOA1P02647 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOA1P02647 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOA1P02647 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOA1P02647 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOA1P02647 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOA1P02647 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms