Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA4FO95754 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA4FO95754 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA4FO95754 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms