Protein–RNA interactions for Protein: O95248

SBF1, Myotubularin-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBF1O95248 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SBF1O95248 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SBF1O95248 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SBF1O95248 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SBF1O95248 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SBF1O95248 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SBF1O95248 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SBF1O95248 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SBF1O95248 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SBF1O95248 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SBF1O95248 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SBF1O95248 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SBF1O95248 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SBF1O95248 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SBF1O95248 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SBF1O95248 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SBF1O95248 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SBF1O95248 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SBF1O95248 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SBF1O95248 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SBF1O95248 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBF1O95248 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBF1O95248 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SBF1O95248 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SBF1O95248 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SBF1O95248 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SBF1O95248 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SBF1O95248 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SBF1O95248 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SBF1O95248 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SBF1O95248 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SBF1O95248 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SBF1O95248 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SBF1O95248 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SBF1O95248 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SBF1O95248 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SBF1O95248 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SBF1O95248 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SBF1O95248 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SBF1O95248 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SBF1O95248 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SBF1O95248 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SBF1O95248 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SBF1O95248 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SBF1O95248 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SBF1O95248 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SBF1O95248 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SBF1O95248 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SBF1O95248 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SBF1O95248 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SBF1O95248 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SBF1O95248 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SBF1O95248 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SBF1O95248 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SBF1O95248 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SBF1O95248 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SBF1O95248 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SBF1O95248 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SBF1O95248 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SBF1O95248 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SBF1O95248 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SBF1O95248 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
SBF1O95248 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBF1O95248 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBF1O95248 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBF1O95248 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBF1O95248 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBF1O95248 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SBF1O95248 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SBF1O95248 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SBF1O95248 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SBF1O95248 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SBF1O95248 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SBF1O95248 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SBF1O95248 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SBF1O95248 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SBF1O95248 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SBF1O95248 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SBF1O95248 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SBF1O95248 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SBF1O95248 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SBF1O95248 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SBF1O95248 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SBF1O95248 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SBF1O95248 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SBF1O95248 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SBF1O95248 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SBF1O95248 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SBF1O95248 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SBF1O95248 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SBF1O95248 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SBF1O95248 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SBF1O95248 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SBF1O95248 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SBF1O95248 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SBF1O95248 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SBF1O95248 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SBF1O95248 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SBF1O95248 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SBF1O95248 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.1 ms