Protein–RNA interactions for Protein: O94979

SEC31A, Protein transport protein Sec31A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31AO94979 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC31AO94979 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEC31AO94979 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEC31AO94979 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEC31AO94979 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEC31AO94979 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEC31AO94979 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SEC31AO94979 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC31AO94979 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC31AO94979 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms