Protein–RNA interactions for Protein: O94886

TMEM63A, CSC1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM63AO94886 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM63AO94886 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM63AO94886 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM63AO94886 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms