Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEC24DO94855 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEC24DO94855 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24DO94855 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms