Protein–RNA interactions for Protein: O75818

RPP40, Ribonuclease P protein subunit p40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPP40O75818 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPP40O75818 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPP40O75818 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPP40O75818 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPP40O75818 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPP40O75818 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPP40O75818 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPP40O75818 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPP40O75818 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPP40O75818 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPP40O75818 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPP40O75818 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPP40O75818 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPP40O75818 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPP40O75818 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPP40O75818 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPP40O75818 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPP40O75818 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPP40O75818 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPP40O75818 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPP40O75818 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPP40O75818 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPP40O75818 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPP40O75818 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPP40O75818 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPP40O75818 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPP40O75818 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPP40O75818 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPP40O75818 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPP40O75818 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPP40O75818 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RPP40O75818 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPP40O75818 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPP40O75818 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPP40O75818 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPP40O75818 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPP40O75818 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPP40O75818 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPP40O75818 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPP40O75818 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPP40O75818 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPP40O75818 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPP40O75818 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPP40O75818 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RPP40O75818 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RPP40O75818 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPP40O75818 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPP40O75818 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPP40O75818 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPP40O75818 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPP40O75818 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPP40O75818 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPP40O75818 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPP40O75818 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPP40O75818 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RPP40O75818 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RPP40O75818 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPP40O75818 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPP40O75818 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPP40O75818 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPP40O75818 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPP40O75818 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPP40O75818 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPP40O75818 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPP40O75818 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPP40O75818 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPP40O75818 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RPP40O75818 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RPP40O75818 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPP40O75818 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPP40O75818 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPP40O75818 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPP40O75818 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPP40O75818 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPP40O75818 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RPP40O75818 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPP40O75818 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPP40O75818 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RPP40O75818 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPP40O75818 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPP40O75818 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPP40O75818 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPP40O75818 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPP40O75818 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPP40O75818 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPP40O75818 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPP40O75818 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPP40O75818 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPP40O75818 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPP40O75818 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPP40O75818 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPP40O75818 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPP40O75818 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPP40O75818 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPP40O75818 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPP40O75818 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPP40O75818 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPP40O75818 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPP40O75818 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPP40O75818 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms