Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CLDN11O75508 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN11O75508 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN11O75508 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms