Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LGR5O75473 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LGR5O75473 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LGR5O75473 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LGR5O75473 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LGR5O75473 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LGR5O75473 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LGR5O75473 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LGR5O75473 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LGR5O75473 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LGR5O75473 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LGR5O75473 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LGR5O75473 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LGR5O75473 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LGR5O75473 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LGR5O75473 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LGR5O75473 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LGR5O75473 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LGR5O75473 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LGR5O75473 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LGR5O75473 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LGR5O75473 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LGR5O75473 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LGR5O75473 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LGR5O75473 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LGR5O75473 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LGR5O75473 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LGR5O75473 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LGR5O75473 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LGR5O75473 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LGR5O75473 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LGR5O75473 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LGR5O75473 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LGR5O75473 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LGR5O75473 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LGR5O75473 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LGR5O75473 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LGR5O75473 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LGR5O75473 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LGR5O75473 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LGR5O75473 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LGR5O75473 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LGR5O75473 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LGR5O75473 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LGR5O75473 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LGR5O75473 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LGR5O75473 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LGR5O75473 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LGR5O75473 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LGR5O75473 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LGR5O75473 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LGR5O75473 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LGR5O75473 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LGR5O75473 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LGR5O75473 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LGR5O75473 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LGR5O75473 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LGR5O75473 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LGR5O75473 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LGR5O75473 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LGR5O75473 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LGR5O75473 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LGR5O75473 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LGR5O75473 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LGR5O75473 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LGR5O75473 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LGR5O75473 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LGR5O75473 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LGR5O75473 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LGR5O75473 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LGR5O75473 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LGR5O75473 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LGR5O75473 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LGR5O75473 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LGR5O75473 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LGR5O75473 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LGR5O75473 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LGR5O75473 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LGR5O75473 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LGR5O75473 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LGR5O75473 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LGR5O75473 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LGR5O75473 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LGR5O75473 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LGR5O75473 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LGR5O75473 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LGR5O75473 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LGR5O75473 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LGR5O75473 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LGR5O75473 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LGR5O75473 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LGR5O75473 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LGR5O75473 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LGR5O75473 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LGR5O75473 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LGR5O75473 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LGR5O75473 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LGR5O75473 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LGR5O75473 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LGR5O75473 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms