Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
VAMP4O75379 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
VAMP4O75379 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
VAMP4O75379 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms