Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH16O75309 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH16O75309 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH16O75309 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH16O75309 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH16O75309 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH16O75309 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH16O75309 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH16O75309 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH16O75309 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH16O75309 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH16O75309 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH16O75309 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH16O75309 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH16O75309 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH16O75309 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH16O75309 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH16O75309 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH16O75309 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH16O75309 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH16O75309 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH16O75309 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH16O75309 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH16O75309 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH16O75309 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH16O75309 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH16O75309 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH16O75309 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH16O75309 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH16O75309 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH16O75309 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH16O75309 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH16O75309 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH16O75309 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH16O75309 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH16O75309 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH16O75309 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH16O75309 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH16O75309 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH16O75309 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH16O75309 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH16O75309 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH16O75309 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH16O75309 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH16O75309 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH16O75309 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH16O75309 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH16O75309 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH16O75309 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH16O75309 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH16O75309 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH16O75309 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH16O75309 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH16O75309 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH16O75309 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH16O75309 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH16O75309 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH16O75309 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH16O75309 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH16O75309 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH16O75309 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH16O75309 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH16O75309 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH16O75309 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH16O75309 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH16O75309 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH16O75309 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH16O75309 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH16O75309 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH16O75309 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH16O75309 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH16O75309 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH16O75309 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH16O75309 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH16O75309 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH16O75309 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH16O75309 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH16O75309 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH16O75309 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH16O75309 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH16O75309 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH16O75309 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH16O75309 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH16O75309 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH16O75309 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH16O75309 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH16O75309 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH16O75309 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH16O75309 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH16O75309 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH16O75309 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH16O75309 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH16O75309 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH16O75309 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH16O75309 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH16O75309 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH16O75309 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH16O75309 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH16O75309 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH16O75309 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms