Protein–RNA interactions for Protein: O75298

RTN2, Reticulon-2, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN2O75298 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN2O75298 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN2O75298 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RTN2O75298 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN2O75298 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN2O75298 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN2O75298 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN2O75298 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTN2O75298 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN2O75298 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN2O75298 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN2O75298 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTN2O75298 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN2O75298 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN2O75298 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN2O75298 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN2O75298 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN2O75298 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN2O75298 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN2O75298 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN2O75298 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN2O75298 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTN2O75298 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTN2O75298 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTN2O75298 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN2O75298 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN2O75298 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN2O75298 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN2O75298 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN2O75298 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN2O75298 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN2O75298 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN2O75298 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTN2O75298 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN2O75298 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN2O75298 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN2O75298 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN2O75298 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN2O75298 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN2O75298 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN2O75298 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN2O75298 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN2O75298 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTN2O75298 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN2O75298 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN2O75298 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN2O75298 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN2O75298 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTN2O75298 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN2O75298 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN2O75298 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN2O75298 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN2O75298 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN2O75298 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN2O75298 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN2O75298 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTN2O75298 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN2O75298 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN2O75298 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN2O75298 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN2O75298 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN2O75298 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN2O75298 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN2O75298 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN2O75298 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTN2O75298 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN2O75298 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN2O75298 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN2O75298 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN2O75298 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN2O75298 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN2O75298 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN2O75298 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN2O75298 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN2O75298 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN2O75298 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN2O75298 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN2O75298 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN2O75298 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN2O75298 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN2O75298 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN2O75298 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN2O75298 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN2O75298 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN2O75298 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN2O75298 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN2O75298 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN2O75298 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN2O75298 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN2O75298 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN2O75298 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN2O75298 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTN2O75298 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTN2O75298 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RTN2O75298 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTN2O75298 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTN2O75298 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTN2O75298 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTN2O75298 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTN2O75298 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms