Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNOT3O75175 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNOT3O75175 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT3O75175 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms