Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MSCO60682 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MSCO60682 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MSCO60682 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MSCO60682 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MSCO60682 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MSCO60682 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MSCO60682 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MSCO60682 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MSCO60682 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MSCO60682 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MSCO60682 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MSCO60682 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MSCO60682 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MSCO60682 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MSCO60682 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSCO60682 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSCO60682 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSCO60682 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSCO60682 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MSCO60682 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSCO60682 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSCO60682 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSCO60682 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSCO60682 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSCO60682 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSCO60682 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MSCO60682 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MSCO60682 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MSCO60682 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MSCO60682 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MSCO60682 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MSCO60682 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MSCO60682 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MSCO60682 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MSCO60682 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MSCO60682 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MSCO60682 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
MSCO60682 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MSCO60682 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
MSCO60682 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MSCO60682 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MSCO60682 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MSCO60682 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MSCO60682 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MSCO60682 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MSCO60682 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MSCO60682 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MSCO60682 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MSCO60682 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MSCO60682 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSCO60682 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSCO60682 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSCO60682 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSCO60682 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSCO60682 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSCO60682 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSCO60682 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSCO60682 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSCO60682 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSCO60682 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSCO60682 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSCO60682 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSCO60682 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSCO60682 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSCO60682 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSCO60682 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSCO60682 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSCO60682 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSCO60682 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSCO60682 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSCO60682 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSCO60682 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSCO60682 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSCO60682 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSCO60682 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSCO60682 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MSCO60682 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MSCO60682 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MSCO60682 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MSCO60682 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MSCO60682 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MSCO60682 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MSCO60682 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MSCO60682 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSCO60682 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSCO60682 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSCO60682 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSCO60682 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSCO60682 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MSCO60682 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MSCO60682 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MSCO60682 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MSCO60682 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MSCO60682 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MSCO60682 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MSCO60682 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MSCO60682 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MSCO60682 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MSCO60682 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms