Protein–RNA interactions for Protein: O60516

EIF4EBP3, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP3O60516 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EIF4EBP3O60516 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EIF4EBP3O60516 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms