Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSPAN6O43657 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN6O43657 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN6O43657 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms