Protein–RNA interactions for Protein: O15514

POLR2D, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2DO15514 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2DO15514 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
POLR2DO15514 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR2DO15514 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms