Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC33.82■■■■□ 3
SYNMO15061 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
SYNMO15061 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SYNMO15061 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SYNMO15061 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SYNMO15061 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SYNMO15061 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SYNMO15061 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SYNMO15061 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SYNMO15061 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SYNMO15061 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SYNMO15061 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SYNMO15061 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SYNMO15061 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SYNMO15061 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SYNMO15061 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SYNMO15061 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC33.79■■■■□ 3
SYNMO15061 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SYNMO15061 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SYNMO15061 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SYNMO15061 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SYNMO15061 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.78■■■■□ 3
SYNMO15061 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SYNMO15061 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SYNMO15061 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SYNMO15061 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SYNMO15061 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33.77■■■■□ 3
SYNMO15061 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SYNMO15061 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC33.77■■■■□ 3
SYNMO15061 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SYNMO15061 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
SYNMO15061 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SYNMO15061 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SYNMO15061 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SYNMO15061 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SYNMO15061 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
SYNMO15061 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SYNMO15061 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SYNMO15061 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYNMO15061 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYNMO15061 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
SYNMO15061 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYNMO15061 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYNMO15061 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYNMO15061 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYNMO15061 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYNMO15061 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYNMO15061 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SYNMO15061 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SYNMO15061 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
SYNMO15061 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SYNMO15061 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYNMO15061 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYNMO15061 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYNMO15061 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYNMO15061 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYNMO15061 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYNMO15061 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYNMO15061 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYNMO15061 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYNMO15061 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SYNMO15061 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYNMO15061 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYNMO15061 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYNMO15061 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYNMO15061 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYNMO15061 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
SYNMO15061 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SYNMO15061 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SYNMO15061 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SYNMO15061 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SYNMO15061 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SYNMO15061 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SYNMO15061 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYNMO15061 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYNMO15061 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYNMO15061 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYNMO15061 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYNMO15061 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYNMO15061 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYNMO15061 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SYNMO15061 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SYNMO15061 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SYNMO15061 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SYNMO15061 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SYNMO15061 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SYNMO15061 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SYNMO15061 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SYNMO15061 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SYNMO15061 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SYNMO15061 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SYNMO15061 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SYNMO15061 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SYNMO15061 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SYNMO15061 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
SYNMO15061 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNMO15061 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNMO15061 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNMO15061 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
SYNMO15061 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms