Protein–RNA interactions for Protein: O14709

ZNF197, Zinc finger protein 197, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF197O14709 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF197O14709 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF197O14709 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF197O14709 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF197O14709 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF197O14709 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF197O14709 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF197O14709 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF197O14709 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF197O14709 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF197O14709 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF197O14709 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF197O14709 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF197O14709 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF197O14709 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF197O14709 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF197O14709 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF197O14709 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF197O14709 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF197O14709 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF197O14709 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF197O14709 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF197O14709 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF197O14709 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF197O14709 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF197O14709 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF197O14709 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF197O14709 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF197O14709 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF197O14709 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF197O14709 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF197O14709 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF197O14709 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF197O14709 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF197O14709 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF197O14709 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms