Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PIK3CDO00329 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PIK3CDO00329 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PIK3CDO00329 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms