Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBXN8O00124 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBXN8O00124 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.4 ms