Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
H3BQV1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
H3BQV1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
H3BQV1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
H3BQV1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
H3BQV1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
H3BQV1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
H3BQV1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
H3BQV1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
H3BQV1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
H3BQV1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
H3BQV1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
H3BQV1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
H3BQV1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
H3BQV1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
H3BQV1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
H3BQV1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
H3BQV1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
H3BQV1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
H3BQV1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
H3BQV1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
H3BQV1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
H3BQV1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
H3BQV1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
H3BQV1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
H3BQV1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
H3BQV1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
H3BQV1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
H3BQV1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
H3BQV1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
H3BQV1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
H3BQV1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
H3BQV1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
H3BQV1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
H3BQV1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
H3BQV1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
H3BQV1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
H3BQV1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
H3BQV1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
H3BQV1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
H3BQV1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
H3BQV1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
H3BQV1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
H3BQV1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
H3BQV1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
H3BQV1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
H3BQV1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
H3BQV1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
H3BQV1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
H3BQV1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
H3BQV1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
H3BQV1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
H3BQV1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
H3BQV1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
H3BQV1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
H3BQV1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
H3BQV1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
H3BQV1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
H3BQV1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
H3BQV1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
H3BQV1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
H3BQV1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H3BQV1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H3BQV1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
H3BQV1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
H3BQV1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H3BQV1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
H3BQV1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H3BQV1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
H3BQV1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
H3BQV1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H3BQV1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H3BQV1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H3BQV1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H3BQV1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H3BQV1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H3BQV1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H3BQV1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H3BQV1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
H3BQV1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H3BQV1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
H3BQV1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
H3BQV1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
H3BQV1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
H3BQV1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
H3BQV1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
H3BQV1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
H3BQV1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
H3BQV1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
H3BQV1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
H3BQV1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
H3BQV1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
H3BQV1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
H3BQV1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
H3BQV1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H3BQV1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H3BQV1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H3BQV1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H3BQV1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
H3BQV1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 344.3 ms