Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SDR42E2A6NKP2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDR42E2A6NKP2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms