Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SERINC4A6NH21 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SERINC4A6NH21 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERINC4A6NH21 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms