Protein–RNA interactions for Protein: A6NGU7

LINC01546, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01546, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01546A6NGU7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01546A6NGU7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms