Protein–RNA interactions for Protein: A6NDZ8

MBD3L4, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L4A6NDZ8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
MBD3L4A6NDZ8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MBD3L4A6NDZ8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms