Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GMNCA6NCL1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms