Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
XIRP2A4UGR9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
XIRP2A4UGR9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms