Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRD1A4D1F6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRD1A4D1F6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
LRRD1A4D1F6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRD1A4D1F6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRD1A4D1F6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRD1A4D1F6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRD1A4D1F6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRD1A4D1F6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRD1A4D1F6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRD1A4D1F6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRD1A4D1F6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms