Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMIM30A4D0T7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMIM30A4D0T7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms