Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SSPOA2VEC9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SSPOA2VEC9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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