Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCDC144AA2RUR9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC144AA2RUR9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC144AA2RUR9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC144AA2RUR9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC144AA2RUR9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC144AA2RUR9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC144AA2RUR9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CCDC144AA2RUR9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC144AA2RUR9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC144AA2RUR9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC144AA2RUR9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC144AA2RUR9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC144AA2RUR9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC144AA2RUR9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCDC144AA2RUR9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC144AA2RUR9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC144AA2RUR9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms