Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms