Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USP15Q9Y4E8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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