Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2J1Q9Y385 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms