Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
POMPQ9Y244 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms