Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGAP1Q9UPQ3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AGAP1Q9UPQ3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGAP1Q9UPQ3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGAP1Q9UPQ3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGAP1Q9UPQ3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGAP1Q9UPQ3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGAP1Q9UPQ3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AGAP1Q9UPQ3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGAP1Q9UPQ3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGAP1Q9UPQ3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGAP1Q9UPQ3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGAP1Q9UPQ3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGAP1Q9UPQ3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGAP1Q9UPQ3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGAP1Q9UPQ3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGAP1Q9UPQ3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGAP1Q9UPQ3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AGAP1Q9UPQ3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AGAP1Q9UPQ3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
AGAP1Q9UPQ3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AGAP1Q9UPQ3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AGAP1Q9UPQ3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AGAP1Q9UPQ3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AGAP1Q9UPQ3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AGAP1Q9UPQ3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AGAP1Q9UPQ3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AGAP1Q9UPQ3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AGAP1Q9UPQ3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGAP1Q9UPQ3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms