Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSEQ9UL01 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms