Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2IRD1Q9UHL9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms